来自UAB和爱荷华州立大学的研究人员首次制作了两种隐颈龟的基因组组装。这些发现，揭示了一个以前未知的三维空间包括爬行动物、鸟类和哺乳动物在内的系统发育组内的Nal基因组结构将有助于开发更有效的海龟co保护策略和推进脊椎动物基因组进化和染色体组织的研究。

这项研究由研究人员Aurora Ruiz-Herrera （UAB）和Nicole Valenzuela（爱荷华州立大学）领导，并得到了进化生物学研究所（csicc - upf）和厄勒姆学院的贡献，发表在《基因组研究》上。

它强调了染色质（遗传物质在细胞核内折叠和包装的三维结构）在调节基因功能和影响进化和物种形成中的关键作用。

科学家在不依赖现有参考模型的情况下，构建了两种短颈龟的全基因组组装。他们利用基因测序和表达方法的结合来实现这一目标。

这些海龟代表着不同的谱系，具有独立进化的性染色体系统：一种使用XX/XY（类似于哺乳动物），而另一种使用ZZ/ZW（如鸟类和鳞翅目动物）。

此外，该研究还揭示了两个谱系中新的三维染色质结构。这种结构涉及染色体折叠模式，使着丝粒和端粒之间能够相互作用，这超出了先前已知的线性基因组中的融合和裂变事件。

这些发现为羊膜动物（包括爬行动物、鸟类和哺乳动物）的三维染色质结构提供了新的见解。

“这些发现拓宽了我们对性染色体进化的认识，并为脊椎动物基因组进化和染色体组织的未来研究提供了坚实的基础，”UAB细胞生物学、生理学和免疫学系以及生物技术和生物医学研究所（IBB）的研究员Aurora-Ruiz Herrera强调说。

科学研究重点模型

本文强调了分析海龟基因组对推进生物过程和进化机制的认识的意义。海龟超长的寿命和对疾病的抵抗力使它们成为各个领域科学研究的重要对象，包括生物医学和保护工作。

解开它们的遗传密码对于确定与这些特征相关的特定基因至关重要，这可能会导致人类健康方面的突破，特别是在长寿和免疫功能等领域。

此外，海龟基因组为研究进化史提供了独特的视角。这些古老的爬行动物已经生存了超过2.5亿年，经受住了全球性的灾难，适应了各种各样的栖息地。

研究它们的基因组成可以增强对适应和生存策略的理解，这不仅对保护海龟物种，而且对保护其他形式的生命都至关重要。

自海龟基因组序列首次发表以来，已经过去了十多年。在此期间，研究人员已经发布了各种龟物种的总共12个基因组组合。其中，有9个片段包含带注释的基因序列。